从样品中提取你的靶蛋白
蛋白分析的第一步是蛋白提取,这就需要释放不同来源样品中的蛋白质。无论通过机械处理还是基于去垢剂的提取方法,都会不可避免地破坏细胞稳态,导致蛋白降解或不稳定。因此,提取过程中蛋白的完整性直接决定了下游蛋白样品分析所得数据的质量。例如,某些提取方法可能在细胞裂解和细胞内含物的溶解方面有效,但可能会导致蛋白变性,影响天然蛋白相互作用的检测和分析。
样品类型
培养的哺乳动物细胞,哺乳动物组织和原代细胞是生理相关的内源性蛋白(包括翻译后修饰)研究,以及过表达系统(瞬时或稳态)的常见样品来源。当提取哺乳动物组织中的蛋白质时,需要一些温和的酶或机械破碎手段来帮助从较复杂组织基质中分离细胞。对于仅通过质膜将细胞内容物与环境隔离开的培养哺乳动物细胞和原代细胞来说,试剂中的去垢剂可打破蛋白-脂质膜双层结构,使总蛋白提取更为容易。通常所研究的或用于重组蛋白表达系统的其他生物体包括细菌、酵母和植物。这些细胞类型含有细胞壁,需要额外使用酶解或机械破碎的方法才能有效释放蛋白。然而,目前已开发出基于去垢剂的解决方案,可有效提取和溶解这些细胞中的蛋白,而无需机械外力破坏。该方法对于处理更多样品数量或使用自动提取和纯化方案来说尤其重要。
蛋白提取适用于 各种动物、植物细胞和组织及细菌、真菌、酵母等样本。
亚细胞分级分离
对于大多数研究来说,只需直接制备全细胞裂解物以获取可溶蛋白样品,用于下游直接检测或进一步纯化与分离。但是,如果在蛋白提取之前将细胞分为不同的区室或细胞器,可以显著提高特定蛋白的产量或富集率。机械裂解通常会破坏所有细胞区室,使分离特定细胞组分变得更加困难。但是,通过谨慎优化试剂,已开发出基于逐级差异去垢剂的方法来分离核蛋白、胞质蛋白和膜蛋白组分。该方法可以将疏水性膜蛋白溶解,使其与亲水蛋白分离,并且可以分离完整细胞核、线粒体和其他细胞器,用于直接研究或分步提取蛋白。
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